菌落自动计数仪主要用于菌落计数，它能成功处理各种类型的培养基和各种类型的菌落，对不同种类的培养皿具有特定的现成参数，是手工计数的很好替代。适用于各类样品卫生学微生物的菌落检测计数，如食品、水、化妆品、消毒液、空气等。